Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gabpb2P81069 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabpb2P81069 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms