Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms