Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms