Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chd1P40201 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chd1P40201 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms