Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grin1P35438 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin1P35438 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin1P35438 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms