Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NapbP28663 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NapbP28663 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NapbP28663 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NapbP28663 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NapbP28663 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NapbP28663 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NapbP28663 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NapbP28663 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms