Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms