Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms