Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ApcsP12246 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms