Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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