Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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