Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm21976J3QNN2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21976J3QNN2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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