Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Samd1D3YXK1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms