Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm6880A3KG45 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm6880A3KG45 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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