Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mbd2Q9Z2E1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms