Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a3Q9QZS0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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