Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Scamp5Q9JKD3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms