Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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