Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp4cQ9D7F7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms