Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Sgo1Q9CXH7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sgo1Q9CXH7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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