Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Khdc3Q9CWU5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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