Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms