Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CsprsQ99388 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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