Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trim7Q923T7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim7Q923T7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim7Q923T7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim7Q923T7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim7Q923T7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim7Q923T7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim7Q923T7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim7Q923T7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim7Q923T7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim7Q923T7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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