Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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