Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Samd4aQ8CBY1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd4aQ8CBY1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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