Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms