Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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