Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tfe3Q64092 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tfe3Q64092 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tfe3Q64092 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tfe3Q64092 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms