Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Foxd1Q61345 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Foxd1Q61345 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxd1Q61345 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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