Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm12888Q3UW77 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms