Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb2Q3UUV9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 529.5 ms