Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms