Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms