Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SREBF2Q12772 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SREBF2Q12772 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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