Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms