Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms