Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pitx2P97474 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pitx2P97474 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms