Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms