Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms