Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms