Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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P18526 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18526 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms