Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TtrP07309 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms