Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Fam240aJ3QNP9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms