Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5861F6VCN9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5861F6VCN9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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