Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1fQ9JIS7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms