Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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