Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syf2Q9D198 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms