Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Snx7Q9CY18 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx7Q9CY18 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Snx7Q9CY18 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Snx7Q9CY18 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx7Q9CY18 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms