Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms